Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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Zbed3Q9D0L1 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zbed3Q9D0L1 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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