Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms