Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sgo1Q9CXH7 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms