Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prkrip1Q9CWV6 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms