Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Khdc3Q9CWU5 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms