Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms