Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Nsmce3Q9CPR8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Nsmce3Q9CPR8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Nsmce3Q9CPR8 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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