Protein–RNA interactions for Protein: Q99N43

Kremen1, Kremen protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kremen1Q99N43 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kremen1Q99N43 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms