Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
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PtprtQ99M80 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 AY761184-201ENSMUST00000071886 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PtprtQ99M80 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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PtprtQ99M80 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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PtprtQ99M80 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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PtprtQ99M80 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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PtprtQ99M80 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 AC166902.2-202ENSMUST00000213191 1038 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gm33016-201ENSMUST00000221224 677 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Cbx3-ps2-201ENSMUST00000099421 544 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprtQ99M80 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms