Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ciao1Q99KN2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ciao1Q99KN2 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ciao1Q99KN2 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ciao1Q99KN2 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ciao1Q99KN2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ciao1Q99KN2 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ciao1Q99KN2 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ciao1Q99KN2 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ciao1Q99KN2 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ciao1Q99KN2 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ciao1Q99KN2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ciao1Q99KN2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ciao1Q99KN2 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ciao1Q99KN2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ciao1Q99KN2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ciao1Q99KN2 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ciao1Q99KN2 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ciao1Q99KN2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ciao1Q99KN2 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ciao1Q99KN2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ciao1Q99KN2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ciao1Q99KN2 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ciao1Q99KN2 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ciao1Q99KN2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms