Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Pacsin3Q99JB8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Pacsin3Q99JB8 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Pacsin3Q99JB8 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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