Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Snx18Q91ZR2 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Snx18Q91ZR2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Snx18Q91ZR2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Snx18Q91ZR2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Snx18Q91ZR2 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Snx18Q91ZR2 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Snx18Q91ZR2 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Snx18Q91ZR2 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Snx18Q91ZR2 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Snx18Q91ZR2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx18Q91ZR2 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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