Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms