Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms