Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Mtmr3Q8K296 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mtmr3Q8K296 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mtmr3Q8K296 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mtmr3Q8K296 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mtmr3Q8K296 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mtmr3Q8K296 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mtmr3Q8K296 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms