Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms