Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC5

Neurl3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl3Q8CJC5 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Neurl3Q8CJC5 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Neurl3Q8CJC5 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms