Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Znf628Q8CJ78 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Znf628Q8CJ78 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Znf628Q8CJ78 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Znf628Q8CJ78 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Znf628Q8CJ78 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Znf628Q8CJ78 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Znf628Q8CJ78 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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Znf628Q8CJ78 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Znf628Q8CJ78 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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