Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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