Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI0

Nedd4l, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4lQ8CFI0 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Nedd4lQ8CFI0 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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Nedd4lQ8CFI0 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Nedd4lQ8CFI0 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Nedd4lQ8CFI0 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Nedd4lQ8CFI0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Nedd4lQ8CFI0 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Nedd4lQ8CFI0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Nedd4lQ8CFI0 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Nedd4lQ8CFI0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nedd4lQ8CFI0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Nedd4lQ8CFI0 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms