Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms