Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrif1Q8CDD9 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms