Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc27Q8CD92 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms