Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms