Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms