Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Usp38Q8BW70 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Usp38Q8BW70 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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Usp38Q8BW70 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Usp38Q8BW70 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Usp38Q8BW70 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Usp38Q8BW70 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Usp38Q8BW70 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Usp38Q8BW70 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Usp38Q8BW70 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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