Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx17Q8BVL3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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