Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms