Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD5

She, SH2 domain-containing adapter protein E, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SheQ8BSD5 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SheQ8BSD5 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms