Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cyp4f39Q8BGU0 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cyp4f39Q8BGU0 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms