Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnf1Q7TSH7 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnf1Q7TSH7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnf1Q7TSH7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnf1Q7TSH7 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms