Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ubfd1Q78JW9 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ubfd1Q78JW9 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ubfd1Q78JW9 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ubfd1Q78JW9 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ubfd1Q78JW9 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ubfd1Q78JW9 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ubfd1Q78JW9 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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