Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Glis3Q6XP49 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Glis3Q6XP49 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Glis3Q6XP49 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Glis3Q6XP49 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Glis3Q6XP49 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Glis3Q6XP49 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Glis3Q6XP49 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Glis3Q6XP49 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Glis3Q6XP49 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Glis3Q6XP49 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Glis3Q6XP49 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Glis3Q6XP49 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Glis3Q6XP49 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Glis3Q6XP49 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms