Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssxb3Q6XAS4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssxb3Q6XAS4 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssxb3Q6XAS4 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssxb3Q6XAS4 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssxb3Q6XAS4 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssxb3Q6XAS4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssxb3Q6XAS4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ssxb3Q6XAS4 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ssxb3Q6XAS4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ssxb3Q6XAS4 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ssxb3Q6XAS4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssxb3Q6XAS4 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssxb3Q6XAS4 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssxb3Q6XAS4 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssxb3Q6XAS4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssxb3Q6XAS4 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ssxb3Q6XAS4 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssxb3Q6XAS4 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ssxb3Q6XAS4 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssxb3Q6XAS4 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssxb3Q6XAS4 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ssxb3Q6XAS4 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssxb3Q6XAS4 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ssxb3Q6XAS4 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ssxb3Q6XAS4 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssxb3Q6XAS4 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssxb3Q6XAS4 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssxb3Q6XAS4 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ssxb3Q6XAS4 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssxb3Q6XAS4 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssxb3Q6XAS4 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssxb3Q6XAS4 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssxb3Q6XAS4 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssxb3Q6XAS4 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssxb3Q6XAS4 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssxb3Q6XAS4 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssxb3Q6XAS4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssxb3Q6XAS4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssxb3Q6XAS4 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssxb3Q6XAS4 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssxb3Q6XAS4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssxb3Q6XAS4 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssxb3Q6XAS4 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssxb3Q6XAS4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssxb3Q6XAS4 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssxb3Q6XAS4 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssxb3Q6XAS4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssxb3Q6XAS4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssxb3Q6XAS4 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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