Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RgmaQ6PCX7 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms