Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrimpolQ6P1E7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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