Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Krt77Q6IFZ6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Krt77Q6IFZ6 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Krt77Q6IFZ6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Krt77Q6IFZ6 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Krt77Q6IFZ6 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Krt77Q6IFZ6 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Krt77Q6IFZ6 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Krt77Q6IFZ6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms