Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop58Q6DFW4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms