Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q6DFW0 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q6DFW0 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms