Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd6Q69ZL1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fgd6Q69ZL1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms