Protein–RNA interactions for Protein: Q64337

Sqstm1, Sequestosome-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sqstm1Q64337 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Sqstm1Q64337 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Sqstm1Q64337 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Sqstm1Q64337 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Sqstm1Q64337 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Sqstm1Q64337 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Sqstm1Q64337 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Sqstm1Q64337 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Sqstm1Q64337 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Sqstm1Q64337 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Sqstm1Q64337 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sqstm1Q64337 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Sqstm1Q64337 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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