Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms