Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Trim28Q62318 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms