Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms