Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms