Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms