Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfrsf8Q60846 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms