Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

Predictions only

Length 3,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RelnQ60841 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RelnQ60841 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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RelnQ60841 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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RelnQ60841 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
RelnQ60841 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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RelnQ60841 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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RelnQ60841 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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RelnQ60841 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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RelnQ60841 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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RelnQ60841 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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RelnQ60841 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Gm12961-201ENSMUST00000120507 1050 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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RelnQ60841 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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RelnQ60841 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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