Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms