Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms